Abra o arquivo [Path para o Magento]/app/code/core/Mage/Install/etc/config.xml e procure pelo seguinte bloco:

<extensions>
   <pdo_mysql/>
</extensions>

Agora que encontramos podemos alterá-lo para:

<extensions>
   <pdo_mysql>1</pdo_mysql>
</extensions>

Com isso você conseguirá prosseguir com sua instalação do Magento e finalizá-la.

IMPORTANTE: Volte o código na programação original após concluir a instalação do Magento.